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硝化细菌是一种好氧性细菌，包括亚硝酸菌和硝酸菌。生活在有氧的水中或砂层中，在氮循环水质净化过程中扮演着很重要的角色。
1，硝化细菌不能当做杀菌药物使用，硝化细菌只是可以抑制其他细菌滋生。当鱼生病时应该直接对症下药，不要听信一些人的话，用高浓度的硝化细菌作治疗药剂，这样很可能就耽误了疾病治疗的最佳时期。
硝化细菌可以在正常养殖中适时的补充，来抑制其他细菌的滋生，从而达到预防细菌性疾病的效果。
2，硝化细菌并无净水的功效。它只是可以分解氨氮和亚硝酸盐等对鱼有毒害作用的物质;抑制蓝藻、裸藻等有害藻类，但是它并不能分解大颗粒的杂质和藻类。
正确的处理水质混浊、悬浮物多的办法是用一些EM菌(乳酸菌、酵母菌等)来分解和絮凝，搭配过滤系统将杂质过滤出去。
3，新水族箱应采取一定措施后再投放硝化细菌。很多人在新购水族箱中加满自来水后，立即倒入大量硝化细菌，所谓“开缸”，应该知道硝化细菌也需要废物(氨氮、亚硝态氮)做“食物”，在新水中往往缺少这些物质，造成硝化细菌活化后，由于缺少“食物”而大量死